检察机关在审查起诉阶段，依法告知了被告人于化源享有的诉讼权利，并依法讯问了被告人，听取了辩护人的意见。抚顺市人民检察院起诉指控：被告人于化源利用职务上的便利，以欺骗的手段非法占有公共财物，数额特别巨大；利用职务上的便利，索取或非法收受他人财物，为他人谋取利益，数额特别巨大；违反国家规定发放贷款，数额特别巨大；财产、支出明显超过合法收入，差额巨大，不能说明来源，依法应当以贪污罪、受贿罪、违法发放贷款罪、巨额财产来源不明罪追究其刑事责任。